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1、缓慢移动原则：
为了避免影响正常的风路状态，柜内操作时手应该尽量平缓移动。
2、物品平行摆放原则：
为了避免物品和物品之间的交叉污染现象产生，在柜内摆放的物品应该尽量呈横向一字摆开，避免回风过程中造成相交叉污染。同时避免堵塞背部回风隔栅影响正常风路。
3、避免震动原则：
柜内尽量避免震动仪器（例如离心机、旋涡振荡器等）的使用，因为震动会使得积留在滤膜上的颗粒物质抖落，导致操作室内部洁净度降低，同时如果在前操作面平衡失败净气型安全柜还会引起对操作者的污染。
4、不同样品柜内移动原则：
柜内两种及以上物品需要移动时，一定遵循低污染性物品向高污染性物品移动原则，避免污染性高的物品在移动过程中产生对柜体内部的大面积污染。
5、明火使用原则：
柜内尽量不要使用明火。因为在明火使用过程中产生的细小颗粒杂质将被带入滤膜区域，这些高温杂质会损伤滤膜。无法避免一定需要使用的时候，宜使用低火苗的本生灯。
